Erkinio encefalito virusų potipių identifikavimas Iksodinėse erkėse Lietuvoje

Abstract

Pagal užkrečiamųjų ligų ir AIDS centro duomenis Lietuvoje erkinio encefalito (EE) registruotų atvejų didėja kiekvienais metais. EE atvejų aptinkama visose Lietuvos apskrityse. Viena iš pagrindinių EE sergamumo didėjimo priežasčių yra globalinis klimato atšilimas, dėl ko pailgėjo erkių aktyvumo periodas bei jų išplitimas į naujus arealus. Yra dvi pagrindinės erkių rūšys EE viruso nešiotojos: Ixodes persulcatus ir Ixodes ricinus. Žinoma, kad Lietuvoje paplitusi I.ricinus erkių rūšis ir aptiktas europietiškas (Vakarų) viruso potipis. I.persulcatus yra sibirietiškojo ir Tolimųjų Rytų viruso potipių nešiotojos ir jos nėra būdingos mūsų regionui. Kadangi I.persulcatus rūšies erkės yra paplitusios šalyse, besiribojančiose su Lietuva (Latvija, Lenkija, Baltarusija, Rusija), manoma, kad šios rūšies erkių atsirado ir Lietuvoje. Šio tyrimo tikslas yra ištirti dabartinio EE viruso paplitimo Ixodidae erkėse Lietuvoje, nustatyti surinktų erkių rūšis ir nustatyti viruso potipius. 2017 metų kovo - rugsėjo mėnesiais buvo surinktos 1884 erkės iš aštuonių Lietuvos apskričių, 18 rajonų. RNR buvo išskirta iš erkių suspensijų, naudojant RNR išskyrimo rinkinį Isolate II RNA Mini Kit (Bioline, Hilden, Germany). Visi mėginiai buvo tiriami siekiant nustatyti EE virusą ir tikrinami tikro laiko atvirkštinės transkriptazės polimerazinę grandininę reakciją (TL-AT-PGR). Surinktos erkės buvo identifikuotos kaip I.ricinus ir Dermacentos reticulatus. EE virusas buvo nustatytas Akmenės rajone. NS3 geno sekų genetinis apibūdinimas parodė, kad štamai priklauso europetiškam potipiui

According to the data of the Communicable Diseases and AIDS Center in Lithuania, cases of tick-borne encephalitis (TBE) are increasing every year. TBE detected in all Lithuanian counties. One of the main causes of the incidence of TBE is global warming, which had increased the period of ticks' activity and their spread to new habitats. There are two main species of ticks, TBE virus (TBEV) carriers: Ixodes persulcatus and Ixodes ricinus. It is known that I.ricinus species is widespread in Lithuania and have European (Western) virus subtype. I.persucatus is carrier of Syberian and Far East strains and they are not typical for our region. Ticks of I. persulcatus are prevalent in countries bordering with Lithuania (Latvia, Poland, Belarus, Russia), so it is believed that this species also appeared in Lithuania. The aim of this study is to investigate the current prevalence of EEV in Ixodidae ticks in Lithuania, to determine the species of collected ticks and to identify the subtypes of the virus. In March-September 2017, 1884 ticks were collected from eight Lithuanian counties, 18 regions. RNR was isolated from tick suspension with Isolate II RNA Mini Kit (Bioline, HIlden, Germany). All samples were tested for TBEV using RT-PCR. Gathered tick were identified as I. ricinus and Dermacentor reticulatus, all TBEV-positive samples were from Šiauliai county, Akmeniai region, Kivyliai village. The genetic characterization of NS3 gene sequences has shown that strains belong to the European subtype