Please use this identifier to cite or link to this item:https://hdl.handle.net/20.500.12259/48307
Type of publication: Straipsnis Clarivate Analytics Web of Science ar/ir Scopus / Article in Clarivate Analytics Web of Science or / and Scopus (S1)
Field of Science: Biologija / Biology (N010)
Author(s): Kupčinskienė, Eugenija;Zybartaitė, Lina;Paulauskas, Algimantas
Title: Comparison of genetic diversity of three Impatiens species from Central Europe and Baltic region
Other Title: Trijų sprigės (Impatiens) rūšių populiacijų genetinė įvairovė Centrinėje Europoje ir Baltijos regione
Is part of: Žemdirbystė = Agriculture. Akademija, Kėdainių raj. : Lietuvos žemdirbystės institutas, 2015, T. 102, Nr. 1
Extent: p. 87-94
Date: 2015
Keywords: Balsaminaceae;Invazija;Sprigė;Svetimkraštės rūšys;Alien species;Balsaminaceae;Diversity;Marker
Abstract: Tyrimo tikslas – įvertinti trijų rūšių sprigių iš dviejų šalių populiacijų genetinę įvairovę, taikant dviejų tipų molekulinius žymeklius. Natūraliai augančios paprastosios (Impatiens noli-tangere) ir invazinių rūšių – smulkiažiedės (Impatiens parviflora) ir bitinės (Impatiens glandulifera) – sprigės kiekvienos rūšies ištirta po 8 populiacijas (po 4 iš Lietuvos ir 4 iš Čekijos Respublikos), iš viso analizuoti 355 individai. Panaudoti 8 atsitiktinai pagausintos polimorfinės DNR (APPD) ir 5 paprastųjų kartotinių sekų intarpų (PKSI) žymekliai. Nepriklausomai nuo šalies ar augimo vietos, rūšies lygmenyje didžiausiu polimorfizmu pagal APPD žymeklius išsiskyrė I. glandulifera (35,2 %), pagal PKSI žymeklius – I. noli-tangere (48 %). Abiejų žymeklių duomenimis, individų bei populiacijų dendrogramose ir taikant principinių koordinačių analizę kiekvienos rūšies populiacijos sudarė atskirus lietuviškus ir čekiškus klasterius. PKSI žymeklių pagrindu sudarytoje dendrogramoje pagal šalis nepasiskirstė tik I. noli-tangere populiacijos. Panaudojus PKSI žymeklius, molekulinė genetinė įvairovė tarp šalių I. noli-tangere populiacijų buvo daug mažesnė (7,3 %) nei I. parviflora (49,7 %) ar I. glandulifera (45,6 %). I. noli-tangere populiacijos pasižymėjo mažiausia genetine diferenciacija (0,36). Abiejų invazinių rūšių atveju pagal PKSI žymeklius populiacijų iš Čekijos polimorfizmas buvo didesnis už populiacijų iš Lietuvos. Atlikus Mantelio testą, abiejų žymeklių duomenimis, kiekvienai sprigių rūšiai nustatyta reikšminga koreliacija tarp populiacijų geografinių ir genetinių atstumų. [...]
The present study is aimed at evaluation of genetic diversity of populations of three Impatiens species from two countries by employing multilocus markers of two different types. The total number of individuals was 355, the number of populations for each species - native Impatiens noli-tangere and invasive-I parvifiora, I. glandulifera, was 8 (4 from Lithuania and 4 from the Czech Republic). Impatiens species were evaluated according to 8 randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) loci and 5 inter-simple sequence repeat (ISSR) loci. Independently of the site, at the species level polymorphism was the highest for I. glandulifera at RAPD loci (35.2%, as a mean per population) and for I noli-tangere at ISSR loci (48%). RAPD and ISSR based dendrograms for individuals and populations also principal coordinate analyses clearly clustered populations of each species according to their countries, except for ISSR based dendrogram for the populations of I noli-tangere. Estimated at ISSR loci, molecular variance among the populations of the two countries was much smaller for native I. noli-tangere (7.3%), when compared to invasive I parviflora (49.7%) or I. glandulifera (45.6%). Genetic differentiation among the populations was the smallest for I noli-tangere (G(ST) = 0.36). The populations of both invasive species from the Czech Republic were more polymorphic at ISSR loci, when compared to those from Lithuania. Mantel test showed significant correlations between geographic and genetic distances in the case of both DNA markers. The Czech Republic's populations were bigger in size, grew in higher altitudes, mean annual temperatures of the site were higher by several degrees and mean annual rainfall was lower compared to Lithuania's. Polymorphisms at RAPD and ISSR loci might play different role for viability of populations of Impatiens species.[...]
Internet: http://www.zemdirbyste-agriculture.lt/wp-content/uploads/2015/03/102_1_str11.pdf
Affiliation(s): Biologijos katedra
Gamtos mokslų fakultetas
Vytauto Didžiojo universitetas
Appears in Collections:Universiteto mokslo publikacijos / University Research Publications

Files in This Item:
marc.xml13.63 kBXMLView/Open

MARC21 XML metadata

Show full item record
Export via OAI-PMH Interface in XML Formats
Export to Other Non-XML Formats

WEB OF SCIENCETM
Citations 5

4
checked on Jun 2, 2020

Page view(s)

156
checked on Mar 5, 2020

Download(s)

18
checked on Mar 5, 2020

Google ScholarTM

Check

Altmetric


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.