Genetic diversity of Bartonella taylorii and Bartonella grahamii strains
| Author | Affiliation | |
|---|---|---|
LT | ||
LT | ||
LT | ||
LT |
| Date |
|---|
2019 |
Skirtingų bakterijų padermės, įskaitant ir Bartonella rūšis, gali būti susijusios su skirtingais stuburiniais šeimininkais bei vektoriais ir aptinkamos skirtinguose geografiniuose regionuose – Šiaurės Amerikos, Australijos, Azijos ir Europos. B. taylorii ir B. grahamii rūšies bakterijos dažnai identifikuojamos pelėse, pelėnuose ir žiurkėse, tačiau vis dar trūksta žinių apie šių bakterijų padermių geografinį pasiskirstymą ir genetinę įvairovę. Šio tyrimo tikslas buvo nustatyti B. taylorii ir B. grahamii padermių genetinę įvairovę pagal rpoB geno ir 16S–23S rRNR vidinio transkribuojančio regiono (ITS) sekas. Atlikus Lietuvoje sugautų pelėnų ir pelių rpoB geno sekų analizę, buvo nustatyta penkiolika B. taylorii ir keturi B. grahamii genotipai; ITS regiono sekų analizės metu nustatyti šeši B. taylorii ir keturi B. grahamii genotipai. Genetinės įvairovės analizė rodo, kad B. grahamii padermės, kilusios iš to paties geografinio regiono ar nedideliu atstumu nutolusių vietovių, yra gana konservatyvios, o B. grahamii padermės, kilusios iš labai nutolusių vietovių, pasižymi didesne sekų įvairove. Geografinis atstumas B. taylorii padermių genetinei įvairovei įtakos neturi.
Bacterial strains are a characteristic feature of many bacterial pathogens, including the species of the genus Bartonella. These bacteria are associated with different vertebrate hosts and vectors and have been detected in North America, Australia, Asia, and Europe. This study presents molecular characterization of Bartonella strains circulating in wild rodents. B. taylorii and B. grahamii are detected with high prevalence in mice, voles, and rats. However, there is a lack of knowledge on the geographical distribution and genetic diversity of B. taylorii and B. grahamii strains in wild rodents. The objectives of this study were to characterize the genetic diversity of B. taylorii and B. grahamii strains by sequence analysis of the housekeeping gene (rpoB) and the 16S-23S rRNA intergenic species region (ITS). Sequence analysis of rpoB gene revealed the presence of 15 B. taylorii genotypes and four B. grahamii genotypes in mice and voles captured in Lithuania. Sequence analysis of the ITS region revealed the presence of six B. taylorii genotypes and four B. grahamii genotypes in Lithuanian voles and mice. Analysis of genetic diversity demonstrated that B. grahamii strains derived from the same geographic region or from regions of close proximity more conservative, while B. grahamii strains from more distant areas are more variable. Genetic diversity of B. taylorii strains seems not to depend on geographic distance.